Projektni tim okupljen ja na platformi Znanstvenog centra izvrsnosti BioProCro. BioProCro je multidisciplinarni centar za biotehnološko istraživanje Jadranskog mora u Hrvatskoj. Okupio je istraživačke grupe iz područja biotehnologije, kemije, farmakologije i drugih disciplina (IRB Zagreb; KTF Split; PBF Zagreb, PTF Osijek; UNIRI Rijeka) s ciljem inovativnog istraživanja bioaktivnih spojeva i materijala te promicanja održivog korištenja biološke raznolikosti. BioProCro integrira fragmentirana istraživanja biotehnologije i resurse kako bi efikasnije koristio postojeću opremu i znanje te potaknuo suradnju između znanosti, industrije i gospodarstva.
Voditeljica projektnog tima je dr.sc. Rozelindra Čož-Rakovac
Projektni tim se sastoji od znanstvenika s pet institucija podijeljenih u deset istraživačkih grupa.
Grupa 1: Biomedicinski znanstvenici, biolozi i ekolozi sudjelovat će u procjeni bioloških aktivnosti ekstrakata i spojeva kroz in vivo (embriji zebrice) i in vitro testove kako bi se procijenili negativni učinci ili pozitivna biološka svojstva (npr., antitumorska, antibakterijska, antifungalna, antioksidacijska, protuupalna, regenerativna, neuroprotektivna, antihipertenzivna i antidiabetička svojstva).
Grupa 2: Molekularni biolozi, biomedicinski znanstvenici i biokemijski inženjeri sudjelovat će u određivanju taksonomskih afilacija odabranih organizama sekvenciranjem amplificiranih molekularnih markera (16S rRNA, rpo, 18S rRNA, ITS). Također će provoditi probir mikroba s potencijalom za sintezu industrijski relevantnih hidrotičkih enzima ili drugih metabolita s industrijskim/medicinskim potencijalom.
Grupa 3: Kemičari i biotehnolozi koristit će različite kromatografske tehnike za ekstrakciju i NMR za kemijsku karakterizaciju bioaktivnih metabolita/spojeva iz odabranih morskih mikro/makroorganizama. Molekule od interesa bit će sintetizirane ili derivatizirane, a po potrebi će se koristiti kiralne tehnologije za njihovu separaciju.
Grupa 4: Računalni znanstvenici razvijat će kemoinformatičku platformu primjenom QSAR metode (temeljene na strojnom učenju) za predviđanje fizikalno-kemijskih svojstava ili bioloških učinaka, te mehanizama djelovanja ciljnih molekula, procjenjujući afinitete vezanja na ciljne proteine.
Grupa 5: Biotehnolozi, biokemijski inženjeri i kemičari će koristiti različite napredne kromatografske metode (uključujući ekstrakciju induciranu plazmom) za pročišćavanje i izolaciju bioaktivnih spojeva, s posebnim naglaskom na polisaharide i male bioaktivne molekule sekundarnih metabolita.
Grupa 6: Biotehnolozi i procesni inženjeri dizajnirat će integrirane bioprocesne sustave za uzgoj mikroorganizama. Ispitivat će održivost tih sustava za proizvodnju odabranih bioaktivnih spojeva. Također će se razviti procedure za provođenje fermentacija u većem mjerilu, uključujući odabir sustava za bioreaktore i kinetiku rasta odabranih mikroorganizama.
Grupa 7: Bioinformatičari i molekularni biotehnolozi sudjelovat će u analizi podataka nove generacije sekvenciranja (NGS) (Illumina, PacBio i Nanopore), čime će doprinijeti analizi genoma i identifikaciji gena uključenih u proizvodnju enzima i bioaktivnih metabolita s potencijalnim primjenama u industriji i medicini.
Grupa 8: Kemičari i biotehnolozi primjenjivat će različite metode koristeći HPLC, ultrazvuk, SPE, ekstrakciju superkritičnim CO2 kao i zelena otapala za izolaciju bioaktivnih spojeva, te identifikaciju aminokiselina, masnih kiselina, pigmenata i fenola.
Grupa 9: Kemičari i biotehnolozi specifično će se usmjeriti na identifikaciju hlapivih spojeva koristeći napredne tehnike (GC/MS, HRMS).
Grupa 10: Kemičari, biokemijski inženjeri i biotehnolozi specifično će se usmjeriti na sintezu odabranih bioaktivnih analoga i njihovu kemijsku karakterizaciju koristeći napredne tehnike (LC-MS/MS).
IRB, Zagreb
IRB je najveći hrvatski znanstvenoistraživački centar multidisciplinarnog karaktera u kojemu se provode provođenjem visokokvalitetna znanstvena istraživanja u područjima prirodnih, biomedicinskih, biotehničkih i tehničkih znanosti, doprinosi visokom obrazovanju te surađuje sa znanstvenom zajednicom i gospodarstvom temeljenom na vrhunskim znanstvenim istraživanjima. Multidisciplinarnost istraživanja organizirana je unutar 11 zavoda (Zavod za teorijsku fiziku, Zavod za eksperimentalnu fiziku, Zavod za fiziku materijala, Zavod za kemiju materijala, Zavod za elektroniku, Zavod za fizičku kemiju, Zavod za organsku kemiju i biokemiju, Zavod za molekularnu biologiju, Zavod za molekularnu medicinu, Centar za istraživanje mora, Zavod za istraživanje mora i okoliša) i 4 centra Instituta (Centar za znanstvene informacije, Centar za NMR, Centar za informatiku i računarstvo, Centar za detektore, senzore i elektroniku). Danas u zavodima IRB-a znanstvenici rade na istraživanjima u teorijskoj i eksperimentalnoj fizici, fizici i kemiji materijala, elektronici, fizičkoj kemiji, organskoj kemiji i biokemiji, molekularnoj biologiji i biomedicini te istraživanju mora i okoliša.
Grupa 1: Rozelindra Čož-Rakovac, Natalija Topić-Popović, Ivančica Strunjak-Perović, Sanja Babić Brčić, Olga Malev, Marijeta Kralj, Mladen Paradžik
Aktivnosti: Ispitivanje biološkog potencijala primarnih i sekundarnih metabolita uz pomoć in vitro i in vivo testova. Sigurnost njihove daljnje primjene bit će utvrđena testovima genotoksičnosti i embriotoksičnosti. Ko-kultivacija mikroalgi i probiotskih bakterija. Probir bakterijskih enzima za eko-industrijsku inovaciju.
Grupa 2: Dušica Vujaklija, Krunoslav Bojanić, Tina Paradžik, Branka Bruvo Mađarić, Ksenija Zahradka
Aktivnosti: Utvrđivanje taksonomske pripadnosti mikro/makroorganizama/mikrobioma provodit će se izolacijom, umnožavanjem i sekvenciranjem molekularnih markera; sekvenciranjem bakterijskih genoma s antimikrobnim potencijalom (A1), razvoj procesa u proizvodnji održive i kružne hrane; probir bakterijskih enzima za eko-industrijsku inovaciju.
Grupa 3: Marin Roje, Andreja Jakas, Darko Kontrec, Ana Čikoš
Aktivnosti: Sinteza odabranih bioaktivnih peptida i malih molekula sekundarnih metabolita. Ekstrakcija i kemijska karakterizacija makro- i mikroorganizama te sinteza bioaktivnih metabolita. Probir bakterijskih enzima za eko-industrijsku inovaciju
Grupa 4: Tomislav Šmuc, Višnja Stepanić, Bono Lucić
Aktivnosti: Razvoj QSAR metoda temeljenih na učenju stroja s ciljem utvrđivanja mehanizama djelovanja i procjene afiniteta vezanja za ciljane proteine
PBF, Zagreb
PBF je sastavnica Sveučilišta s pravnom osobnosti koja obavlja djelatnost visokog obrazovanja te znanstvenu i stručnu djelatnost u znanstvenom području biotehničkih znanosti, znanstvenim poljima prehrambene tehnologije, biotehnologije i nutricionizma. PBF provodi prijediplomsko, diplomsko i poslijediplomsko obrazovanje na području prehrambene tehnologije, biotehnologije i nutricionizma utemeljeno na znanstvenim, temeljnim, primijenjenim i razvojnim istraživanjima radi stvaranja novih znanja i ideja, poticanja kritičkoga promišljanja i kreativnosti, te transfera znanja i inovacija u gospodarstvo i društvo.
Grupa 5: Verica Dragović Uzelac, Ivona Elez Garofulić, Maja Repajić, Sandra Balbino, Sandra Pedisić,
Aktivnosti: Ekstrakcija, pročišćavanje i izolacija bioaktivnih spojeva te njihova kemijska karakterizacija korištenjem različitih kromatografskih metoda (GC, HPLC, itd.)
Grupa 6: Božidar Šantek, Mirela Ivančić Šantek, Antonia Trontel, Mario Novak, Blaženka Kos
Aktivnosti: Kultivacija biomase odabranih radnih mikroorganizama, odabir bioreaktorskog sustava i oblikovanje tehnoloških procesa za ekstrakciju biomase. Procjena održivosti razvijenih integriranih bioprocesnih sustava za proizvodnju odabranih bioaktivnih spojeva
Grupa 7: Antonio Starčević, Jurica Žučko, Janko Diminić,
Aktivnosti: Sastavljanje i anotacija sekvenciranih genoma te identifikacija gena i genetskih klastera odgovornih za sintezu antimikrobnih metabolita i hidrolitičkih enzima pomoću in silico metoda
PTF, Osijek
PTF stremi nacionalno i međunarodno prepoznatoj izvrsnosti u obrazovanju i istraživanju u biotehničkim, tehničkim i prirodnim znanostima te primjeni znanja za dobrobit društva. Osigurava mobilnost studenata i nastavnika, efikasno koristi resurse te kontinuirano unaprjeđuje kvalitetu i konkurentnost nastavnog i znanstvenog rada. Kroz razvojnu strategiju temeljenu na izvrsnosti, ostvaruje svoju misiju.
Grupa 8: Stela Jokić, Krunoslav Aladić, Ivana Flanjak
Aktivnosti: Ekstrakcija bioaktivnih spojeva korištenjem ultrazvuka, SPE, ekstrakcija superkritičnim CO2 te identifikacija aminokiselina, masnih kiselina, pigmenata i fenola pomoću HPLC
KTF, Split
KTF se sastoji od ustrojbenih jedinica temeljenih na nastavnom i znanstveno-istraživačkom radu te administrativno tehničkom procesu rada. Ustrojbene jedinice Fakulteta su Odsjek za kemiju, Odsjek za inženjerstvo i tehnologije, Dekanat, Centar za informatičku podršku i Knjižnica. Unutar odsjeka ustrojeni su zavodi i katedra kao temeljne ustrojbene jedinice znanstveno-istraživačkog i nastavnog rada na Fakultetu.
Grupa 9: Igor Jerković, Ani Radonić, Marina Zekić, Zvonimir Marijanović, Sanja Radman
Aktivnosti: Identifikacija hlapljivih spojeva korištenjem GC/MS i HRMS
FABRI_UNIRI, Rijeka
UNIRI Fakultet biotehnologije i istraživanje lijekova, prethodnog naziva Odjel za biotehnologiju Sveučilišta u Rijeci, predstavlja i zastupa dekanica koja upravlja radom i odgovorna je za provedbu djelatnosti Fakulteta. Uz dekanicu imenovane su prodekanice za nastavu, znanost te financije i suradnju sa gospodarstvom. UNIRI su nastavnici koji pripremaju studente za poslove budućnosti i građansku odgovornost; istraživači koji otvaraju i osnažuju Sveučilište ulazeći u inovativne istraživačke pothvate i suradnje kako bi razvijali gospodarstvo i unaprijedili dobrobit lokalne zajednice.
Grupa 10: Dean Marković, Nikolina Vidović, Željka Maglica, Milan Mesić
Aktivnosti: Sintetiziranje odabranih bioaktivnih analoga i njihova kemijska karakterizacija (LC-MS/MS)
Novozaposleni mladi znanstvenici
U sklopu projekta zaposleno je jedanaest mladih visokoobrazovanih znanstvenika iz prirodnih, biomedicinskih, biotehničkih ili tehničkih znanosti.